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O uso da biologia como fonte de inspiração para o desenvolvimento de algoritmos levou à criação dos algoritmos genéticos, das redes neurais e do algoritmo da otimização da colônia de formigas, para citarmos alguns. Na disciplina implementamos os algoritmos bioinspirados na linguagem Python. Desenvolvemos aplicações desses algoritmos para o estudo das estruturas de proteínas, como as descritas no vídeo ao lado.

Prof. Walter F. de Azevedo Jr., PhD.

Crystallization of protein in a microgravity environment (video in Portuguese). Experiments carried out on the Discovery space shuttle STS-95 on October 29, 1998.

Video about protein crystallography (Dr. José Henrique Pereira, Molecular Biophysics & Integrated Bioimaging, LBNL, Berkeley, CA, USA).

Pereira JH, de Oliveira JS, Canduri F, Dias MV, Palma MS, Basso LA, Santos DS, de Azevedo WF Jr. Structure of shikimate kinase from Mycobacterium tuberculosis reveals the binding of shikimic acid. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 2004; 60(Pt 12 Pt 2): 2310-9.

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Computação Bioinspirada   

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Projetos Sugeridos         

     -Acetylcholinesterase (EC 3.1.1.7)   PubMed   MOTM                   
     -Beta-Lactamase (or Cephalosporinase) (EC 3.5.2.6)   PubMed   MOTM            
     -Chorismate Synthase (EC 4.2.3.5)   PubMed   
     -Cyclin-Dependent Kinase 1 (EC 2.7.11.22)   PubMed       
     -Cyclin-Dependent Kinase 2 (EC 2.7.11.22)   PubMed       
     -Cyclin-Dependent Kinase 4 (EC 2.7.11.22)   PubMed       
     -Cyclin-Dependent Kinase 5 (EC 2.7.11.22)   PubMed       
     -Cyclin-Dependent Kinase 6 (EC 2.7.11.22)   PubMed       
     -Cyclooxygenase-1 and 2 (EC 1.14.99.1)   PubMed   MOTM   
     -Cytochrome P450 2C9 (EC 1.14.13.-)   PubMed   MOTM   
     -Dihydrofolate Reductase (or Tetrahydrofolate Dehydrogenase) (EC 1.5.1.3)   PubMed   MOTM   
     -Enoyl-[Acyl-Carrier-Protein] Reductase (NADH) (or Enoyl-ACP Reductase) (EC 1.3.1.9)   PubMed   
     -3-enol-pyruvoylshikimate-5-phosphate synthase (EPSP synthase) (EC 2.5.1.19)   PubMed     
     -Epidermal Growth Factor Receptor ErbB1 (EC 2.7.10.1)   PubMed   MOTM     
     -Human Immunodeficiency Virus Type 1 Integrase (EC 2.7.7.-)   PubMed   MOTM   
     -Human Immunodeficiency Virus Type 1 Protease (EC 3.4.23.16)   PubMed   MOTM   
     -Human Immunodeficiency Virus Type 1 Reverse Transcriptase (EC 2.7.7.49)   PubMed  MOTM   
     -Neuraminidase (or Exo-Alpha-Sialidase) (EC 3.2.1.18)   PubMed   MOTM   
     -Purine Nucleoside Phophorylase (or Inosine Phosphorylase) (EC 2.4.2.1)   PubMed   
     -Serotonin Receptor   PubMed   MOTM    

     -Shikimate Kinase (EC 2.7.1.71)   PubMed   
     -Tyrosine-Protein Kinase SRC (EC 2.7.10.2)   PubMed  MOTM   

Links Relacionados     

     -Pesquisadores Mais Citados Mundialmente (Interação Proteína Ligante) no Google Scholar          
     -Pesquisadores Mais Citados Mundialmente (Docking Molecular) no Google Scholar 
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