Books

 

 

 

Projects

 

 

 

Citation

 

Editorships

Avatar

Frontiers Section Editor (Bioinformatics and Biophysics) for the Current Drug Targets ISSN: 1873-5592

Avatar

Section Editor (Bioinformatics in Drug Design and Discovery) for the Current Medicinal Chemistry ISSN: 1875-533X

Avatar

Member of the Editorial Board for the PeerJ ISSN: 2167-8359

Avatar

Member of the Editorial Board for the Current Bioinformatics ISSN: 2212-392X (Online) ISSN: 1574-8936 (Print)

 

Research

Avatar

Protein-Ligand Interacions

Avatar

Molecular Docking

Avatar

Bioinspired Computing

Avatar

Computational Systems Biology

 

Recent Publications

Avatar

Volkart PA et al. Curr Drug Targets. 2019;20(7):716-726

Avatar

Russo S, De Azevedo WF. Curr Med Chem 2019. 26(10):1908-1919






O foco desta disciplina é o ensino da linguagem de programação Python para a resolução de problemas de bioinformática. Estudamos a manipulação de arquivos com informação biológica, como arquivos FASTA e Protein Data Bank (PDB). São implementados códigos em Python para a análise da estrutura tridimensional de proteínas determinadas a partir de cristalografia de difração de raios X, como as proteínas descritas no vídeo ao lado.  

Prof. Walter F. de Azevedo Jr., PhD.

Crystallization of protein in a microgravity environment (video in Portuguese). Experiments carried out on the Discovery space shuttle STS-95 on October 29, 1998.  

Video about protein crystallography (Dr. José Henrique Pereira, Molecular Biophysics & Integrated Bioimaging, LBNL, Berkeley, CA, USA).

Pereira JH, de Oliveira JS, Canduri F, Dias MV, Palma MS, Basso LA, Santos DS, de Azevedo WF Jr. Structure of shikimate kinase from Mycobacterium tuberculosis reveals the binding of shikimic acid. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 2004; 60(Pt 12 Pt 2): 2310-9.

PubMed  PDB   

Projetos Sugeridos                 

Links para Bibliotecas e Cursos de Python